RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 PMEPA1Q969W9 287 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 ACDQ96AP0 544 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 SORBS3O60504 671 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 MMP20O60882 483 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 BCRP11274 1271 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.04□□□□□ -1.28
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POLR1B-215ENST00000498054 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 FBF1Q8TES7 1133 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 SLC30A3Q99726 388 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.04□□□□□ -1.28
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POLR1B-215ENST00000498054 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 PI16Q6UXB8 463 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 ZFATQ9P243 1243 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 GNA15P30679 374 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 DAB2P98082 770 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 TMC4Q7Z404 712 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 BACH2Q9BYV9 841 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 CHRDQ9H2X0 955 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 NPHS2Q9NP85 383 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 HCN2Q9UL51 889 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 BMP4P12644 408 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 OR13H1Q8NG92 308 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 EDN3P14138 238 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 VAMP1P23763 118 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 PLAURQ03405 335 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 HYAL2Q12891 473 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT12Q8IXK2 581 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 FRMD6Q96NE9 622 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 EHD4Q9H223 541 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 PPP4R2Q9NY27 417 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 AK5Q9Y6K8 562 aa7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 OIP5O43482 229 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 MAP3K6O95382 1288 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 TCF3P15923 654 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 SPACA7Q96KW9 195 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 EFCC1Q9HA90 598 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 ABCC9O60706 1549 aa6.99□□□□□ -1.29
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POLR1B-215ENST00000498054 MAP2K3P46734 347 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 FAM182BQ5T319 152 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 PODNQ7Z5L7 613 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 SYT9Q86SS6 491 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 BCO2Q9BYV7 579 aa6.98□□□□□ -1.29
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POLR1B-215ENST00000498054 J3QW42 95 aa6.97□□□□□ -1.29
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POLR1B-215ENST00000498054 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.97□□□□□ -1.29
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POLR1B-215ENST00000498054 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 C12orf49Q9H741 205 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1B-215ENST00000498054 C2CD2LO14523 706 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 IGHA1P01876 353 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 OSMRQ99650 979 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 TRPA1O75762 1119 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GHRHP01286 108 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 USP17L7P0C7H9 530 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ACPPP15309 386 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SOX18P35713 384 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 NRLP54845 237 aa6.95□□□□□ -1.3
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