RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCD1P33897 745 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 RETREG2Q8NC44 543 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 TIGD1Q96MW7 591 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 FMNL2Q96PY5 1086 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 NARFQ9UHQ1 456 aa5.5□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 DOT1LQ8TEK3 1739 aa5.49□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 CAPN15O75808 1086 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINB2P05120 415 aa5.49□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 TNS4Q8IZW8 715 aa5.49□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 CNBD1Q8NA66 436 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 PMM1Q92871 262 aa5.49□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.49□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 JMYQ8N9B5 988 aa5.48□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 MNS1Q8NEH6 495 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.48□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC93Q567U6 631 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 COL15A1P39059 1388 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-213ENST00000496055 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 10.6
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