RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 TRPM2O94759 1503 aa3.94□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 EFCAB6Q5THR3 1501 aa3.94□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 CD109Q6YHK3 1445 aa3.94□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.94□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 PPLO60437 1756 aa3.94□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 IQGAP1P46940 1657 aa3.94□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.93□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa3.93□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa3.93□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.93□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa3.92□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 MLH3Q9UHC1 1453 aa3.92□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 MADDQ8WXG6 1647 aa3.92□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 PREX1Q8TCU6 1659 aa3.92□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 C16orf46Q6P387 395 aa3.92□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 TMC7Q7Z402 723 aa3.92□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 ZNF358Q9NW07 568 aa3.92□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.92□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa3.91□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.91□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa3.91□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.91□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
SMYD3-215ENST00000490322 VTI1BQ9UEU0 232 aa3.91□□□□□ -1.78
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SMYD3-215ENST00000490322 GDF10P55107 478 aa3.9□□□□□ -1.79
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SMYD3-215ENST00000490322 ECM1Q16610 540 aa3.9□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.9□□□□□ -1.79
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SMYD3-215ENST00000490322 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.9□□□□□ -1.79
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SMYD3-215ENST00000490322 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
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SMYD3-215ENST00000490322 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.9□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa3.9□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 NEFLP07196 543 aa3.89□□□□□ -1.79
SMYD3-215ENST00000490322 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
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