RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 GGA1Q9UJY5 639 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ECE2O60344 883 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 CASP7P55210 303 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 PSMD14O00487 310 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 SHTN1A0MZ66 631 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 BEND3Q5T5X7 828 aa23.93■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.93■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 RTL9Q8NET4 1388 aa23.92■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 XDHP47989 1333 aa23.92■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 G3V3G9 751 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 MICALL2Q8IY33 904 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 TRAF5O00463 557 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 ITGA6P23229 1130 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 ATP2B4P23634 1241 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 FAM161AQ3B820 660 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 CNTNAP1P78357 1384 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-211ENST00000482015 H7C1D1 291 aa23.89■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 CSF1RP07333 972 aa23.89■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 DPF2Q92785 391 aa23.89■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.88■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 CACNA1FO60840 1977 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 E9PSI1 815 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 PCNTO95613 3336 aa23.86■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 FOXO4P98177 505 aa23.86■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 EGFRP00533 1210 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 VEGFBP49765 207 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 SLFN5Q08AF3 891 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 CST9Q5W186 159 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 MYH3P11055 1940 aa23.84■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 RASSF10A6NK89 507 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 CCER2I3L3R5 266 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 GRM8O00222 908 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-211ENST00000482015 MED23Q9ULK4 1368 aa23.82■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 PODNQ7Z5L7 613 aa23.82■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 ALDH1L1O75891 902 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 SPEF2Q9C093 1822 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 SCN9AQ15858 1988 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 CHRNDQ07001 517 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 USP48Q86UV5 1035 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 USP17L3A6NCW0 530 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 USP17L4A6NCW7 530 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 KLRK1P26718 216 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 IFFO2Q5TF58 517 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 DLK2Q6UY11 383 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.78■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.78■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.78■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 SNAP23O00161 211 aa23.77■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 TAF5LO75529 589 aa23.77■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
UPP1-211ENST00000482015 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms