RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 C4BP0C0L5 1744 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 RTL9Q8NET4 1388 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 MRE11P49959 708 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 HSPA4P34932 840 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 METTL24Q5JXM2 366 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 TICAM2Q86XR7 235 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 SNRKQ9NRH2 765 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 SPEF2Q9C093 1822 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 ZPR1O75312 459 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 NEK4P51957 841 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 CUL4AQ13619 759 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 ATP2B3Q16720 1220 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 XAGE2Q96GT9 111 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 FAM227BQ96M60 508 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 PALD1Q9ULE6 856 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 ABCC12Q96J65 1359 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 GORABQ5T7V8 394 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 PDE8BO95263 885 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 TMX3Q96JJ7 454 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 NYXQ9GZU5 481 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-204ENST00000476231 SMIM5Q71RC9 77 aa22.89■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 MED23Q9ULK4 1368 aa22.89■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 C4AP0C0L4 1744 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 A0A0D9SFI3 127 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 ADORA1P30542 326 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 SETDB2Q96T68 719 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.88■■□□□ 1.25
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SYF2-204ENST00000476231 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.87■■□□□ 1.25
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SYF2-204ENST00000476231 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 ADRA2BP18089 450 aa22.86■■□□□ 1.25
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SYF2-204ENST00000476231 PTH1RQ03431 593 aa22.86■■□□□ 1.25
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SYF2-204ENST00000476231 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 RFC4P35249 363 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.85■■□□□ 1.25
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SYF2-204ENST00000476231 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 TRIM37O94972 964 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-204ENST00000476231 KCNB2Q92953 911 aa22.84■■□□□ 1.25
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SYF2-204ENST00000476231 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 PHF14O94880 888 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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