RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	OPLAH	O14841	1288 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	XYLB	O75191	536 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	SPINK2	P20155	84 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	MMP20	O60882	483 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	DPYD	Q12882	1025 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	CEP41	Q9BYV8	373 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	WISP1	O95388	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	WNT11	O96014	354 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	SOX18	P35713	384 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	ACAD11	Q709F0	780 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	DTX1	Q86Y01	620 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	HMX2	A2RU54	273 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	PTK7	Q13308	1070 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	RNF43	Q68DV7	783 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	MYO19	Q96H55	970 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	FOXO3	O43524	673 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	MYRFL	Q96LU7	910 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L21	D6R901	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	WEE1	P30291	646 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	CDC25B	P30305	580 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	NACAD	O15069	1562 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	WIZ	O95785	1651 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	NLRP13	Q86W25	1043 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	GLMN	Q92990	594 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	CDC27	P30260	824 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	ATP11A	P98196	1134 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	TM4SF5	O14894	197 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	FSCN2	O14926	492 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	BMP3	P12645	472 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	FLII	Q13045	1269 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SUMO1-210	ENST00000469034	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25

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