RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MCM4	P33991	863 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP2K2	P36507	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ESPN	B1AK53	854 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPP2R1A	P30153	589 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LBX1	P52954	281 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRAK2	O60296	914 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BBOX1	O75936	387 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNIP1	Q15025	636 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KCNQ3	O43525	872 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MCM10	Q7L590	875 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HLF	Q16534	295 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SNX21	Q969T3	373 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676		H7C1D1	291 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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