RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 MED23Q9ULK4 1368 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ATP5JP18859 108 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 CASP7P55210 303 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 RNF20Q5VTR2 975 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PSMA5P28066 241 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 KIF20AO95235 890 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 KRT85P78386 507 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 STK3Q13188 491 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 MAP3K11Q16584 847 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 STRN4Q9NRL3 753 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 CPDO75976 1380 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 TAF5LO75529 589 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 COL15A1P39059 1388 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 SNRKQ9NRH2 765 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ATP2B3Q16720 1220 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 FOXO4P98177 505 aa25.33■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 TTC6Q86TZ1 520 aa25.33■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 FERMT3Q86UX7 667 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 PTGS1P23219 599 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 RPS6KB1P23443 525 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TIMM10P62072 90 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TYRO3Q06418 890 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GLI3P10071 1580 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ABCC6O95255 1503 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CAMK4Q16566 473 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ANKRD7Q92527 254 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ELP1O95163 1332 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 H7C1W4 665 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ZNF609O15014 1411 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LUZP1Q86V48 1076 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LIG1P18858 919 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 PDCP20941 246 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LRRC24Q50LG9 513 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 HAUS7Q99871 368 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TNMDQ9H2S6 317 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GOLIM4O00461 696 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 IL2RBP14784 551 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 DRC7Q8IY82 874 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ANKRD1Q15327 319 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CBX8Q9HC52 389 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 DACT1Q9NYF0 836 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CYP21A2P08686 494 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 EVA1CP58658 441 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 JCADQ9P266 1359 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 NEK1Q96PY6 1258 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 SPATA32Q96LK8 384 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 SLAIN2Q9P270 581 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 TRIM5Q9C035 493 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 Q6ZUG5 572 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 LRMPQ12912 555 aa25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 JAK2O60674 1132 aa25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ZNF75DP51815 510 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms