RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 MED23Q9ULK4 1368 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ATP5JP18859 108 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 CASP7P55210 303 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 RNF20Q5VTR2 975 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PSMA5P28066 241 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 KIF20AO95235 890 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 KRT85P78386 507 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 STK3Q13188 491 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 MAP3K11Q16584 847 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 STRN4Q9NRL3 753 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 CPDO75976 1380 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 TAF5LO75529 589 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 COL15A1P39059 1388 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 SNRKQ9NRH2 765 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ATP2B3Q16720 1220 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 FOXO4P98177 505 aa25.33■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 TTC6Q86TZ1 520 aa25.33■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 FERMT3Q86UX7 667 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 PTGS1P23219 599 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 RPS6KB1P23443 525 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TIMM10P62072 90 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TYRO3Q06418 890 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GLI3P10071 1580 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ABCC6O95255 1503 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CAMK4Q16566 473 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ANKRD7Q92527 254 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ELP1O95163 1332 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 H7C1W4 665 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ZNF609O15014 1411 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LUZP1Q86V48 1076 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LIG1P18858 919 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 PDCP20941 246 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LRRC24Q50LG9 513 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 HAUS7Q99871 368 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 TNMDQ9H2S6 317 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 GOLIM4O00461 696 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 IL2RBP14784 551 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 DRC7Q8IY82 874 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-202ENST00000445482 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ANKRD1Q15327 319 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CBX8Q9HC52 389 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 DACT1Q9NYF0 836 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CYP21A2P08686 494 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 EVA1CP58658 441 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 JCADQ9P266 1359 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 NEK1Q96PY6 1258 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 SPATA32Q96LK8 384 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 SLAIN2Q9P270 581 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 TRIM5Q9C035 493 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 Q6ZUG5 572 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 LRMPQ12912 555 aa25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 JAK2O60674 1132 aa25.22■■□□□ 1.63
VGF-202ENST00000445482 ZNF75DP51815 510 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms