RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 RASEFQ8IZ41 740 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CHGBP05060 677 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 GORABQ5T7V8 394 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5-204ENST00000412806 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.02■■□□□ 1.76
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SH3BP5-204ENST00000412806 COL4A1P02462 1669 aa26.01■■□□□ 1.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 MAP4K1Q92918 833 aa26■■□□□ 1.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 RTL9Q8NET4 1388 aa26■■□□□ 1.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 ERFEQ4G0M1 354 aa26■■□□□ 1.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 KCNB2Q92953 911 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GUL6 1792 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCC12Q96J65 1359 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 MCM2P49736 904 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 SCARF1Q14162 830 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 ZPR1O75312 459 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 TAF5LO75529 589 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.96■■□□□ 1.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 KCNJ4P48050 445 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC27A2O14975 620 aa25.93■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 PHF14O94880 888 aa25.92■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.92■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 LPIN2Q92539 896 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.9■■□□□ 1.74
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SH3BP5-204ENST00000412806 CUL4AQ13619 759 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC102BQ68D86 513 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM37O94972 964 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 RFC4P35249 363 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 PHKA1P46020 1223 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 AK2P54819 239 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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