RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFT43Q96FT9 208 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BCS1LQ9Y276 419 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADAMTS2O95450 1211 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ETFBP38117 255 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AMPD3Q01432 767 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DGKZQ13574 1117 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XKR5Q6UX68 686 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLK14Q9P0G3 267 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A6NHS1 94 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEFLP07196 543 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SOX9P48436 509 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANAPC15P60006 121 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CBLBQ13191 982 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.35□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCRIBQ14160 1630 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SERTM1A2A2V5 107 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC6O75061 913 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP17L7P0C7H9 530 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TIMP2P16035 220 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NNTQ13423 1086 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB33AQ14088 237 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYP2U1Q7Z449 544 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NBPF11Q86T75 865 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TREML1Q86YW5 311 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MPNDQ8N594 471 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR152Q8TDT2 470 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNTG2Q9NY99 539 aa5.34□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNFRSF21O75509 655 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLSTN1O94985 981 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADH1CP00326 375 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPC25Q9HBM1 224 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.33□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYNJ2O15056 1496 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRBA1A5PL33 1030 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BMP2P12643 396 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GARTP22102 1010 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITGB7P26010 798 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LILRB2Q8N423 598 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NGLY1Q96IV0 654 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPON2Q9BUD6 331 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMX1Q9H3N1 280 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GINM1Q9NU53 330 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms