RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 NGLY1Q96IV0 654 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TOM1O60784 492 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 NECAB1Q8N987 351 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL9O00512 1426 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TCIRG1Q13488 830 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF20Q5VTR2 975 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FIBPO43427 364 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP5JP18859 108 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 UVSSAQ2YD98 709 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V1AP38606 617 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD1Q15327 319 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF5LO75529 589 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS6KB1P23443 525 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL34Q8N239 644 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 PHLPP1O60346 1717 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 ITPK1Q13572 414 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGB4P16144 1822 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 SNAP23O00161 211 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 GREM2Q9H772 168 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCP20941 246 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 ADORA1P30542 326 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 NLRP10Q86W26 655 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLIM4O00461 696 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 SIK1P57059 783 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 PI16Q6UXB8 463 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 HAUS7Q99871 368 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT32Q14532 448 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF609O15014 1411 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GUL7 405 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 EYA2O00167 538 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.23■■□□□ 1.15
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SH3BP1-201ENST00000357436 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT85P78386 507 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC6Q86TZ1 520 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 ELP1O95163 1332 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 USP25Q9UHP3 1055 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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SH3BP1-201ENST00000357436 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGA6P23229 1130 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 FERMT3Q86UX7 667 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 NEK1Q96PY6 1258 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.2■■□□□ 1.14
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