RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 TMX3Q96JJ7 454 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 LY75O60449 1722 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 LAMB2P55268 1798 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 RPS6KA4O75676 772 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ4P48050 445 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 TAF5LO75529 589 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-201ENST00000331789 CPA1P15085 419 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 SPEF2Q9C093 1822 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 GNPATO15228 680 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 PDE8BO95263 885 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 13.5
ACTB-201ENST00000331789 SCARF1Q14162 830 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 LRP5O75197 1615 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 SCN7AQ01118 1682 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 SLC27A2O14975 620 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 MCM4P33991 863 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 ERFEQ4G0M1 354 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 TTC14Q96N46 770 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 NARFQ9UHQ1 456 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 SSFA2P28290 1259 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 CUL4AQ13619 759 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 CASZ1Q86V15 1759 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 ZAP70P43403 619 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 AK2P54819 239 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 PI16Q6UXB8 463 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 IL27Q8NEV9 243 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 RTL9Q8NET4 1388 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 COL4A1P02462 1669 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-201ENST00000331789 ZPR1O75312 459 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 FGFR2P21802 821 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 TICAM2Q86XR7 235 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 TAF1P21675 1872 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 C4BP0C0L5 1744 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 ABCC12Q96J65 1359 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 RGL2O15211 777 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 MCAMP43121 646 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 RUFY3Q7L099 469 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 SNAP23O00161 211 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 PKP1Q13835 747 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 RNF20Q5VTR2 975 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 LPIN2Q92539 896 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 PHKA1P46020 1223 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 MYH7P12883 1935 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 VPS53Q5VIR6 699 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 CCDC102BQ68D86 513 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 SETDB2Q96T68 719 aa21.43■■□□□ 1.02
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