RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 LY75O60449 1722 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 SLC27A2O14975 620 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 TAF5LO75529 589 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 LAMB2P55268 1798 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 LRP5O75197 1615 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC12Q96J65 1359 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 PDE8AO60658 829 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 RUFY3Q7L099 469 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 PKP1Q13835 747 aa22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 SCN7AQ01118 1682 aa22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 BRD1O95696 1058 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 SUSD4Q5VX71 490 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 KRT32Q14532 448 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 PARP10Q53GL7 1025 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 GOLIM4O00461 696 aa22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ITGA6P23229 1130 aa22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 GREM2Q9H772 168 aa22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 RGL2O15211 777 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 GORABQ5T7V8 394 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD1Q15327 319 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 FAM182BQ5T319 152 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 MCTP1Q6DN14 999 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 XAGE2Q96GT9 111 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 MYH7P12883 1935 aa22.09■■□□□ 1.13
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HCLS1-201ENST00000314583 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 NTSR2O95665 410 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 KCNQ4P56696 695 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ATP2B3Q16720 1220 aa22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-201ENST00000314583 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 CPA1P15085 419 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 RPS6KB1P23443 525 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 FSD2A1L4K1 749 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 RPS6KA4O75676 772 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 ADORA1P30542 326 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 RTL9Q8NET4 1388 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.04■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.04■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.04■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 C4BP0C0L5 1744 aa22.04■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.03■■□□□ 1.12
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