RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.22■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.22■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 POLD1P28340 1107 aa27.21■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 SRGNP10124 158 aa27.21■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CTU2-201ENST00000312060 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.2■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.2■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.2■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 NPR1P16066 1061 aa27.19■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 MX1P20591 662 aa27.19■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 A0A1B0GUL6 1792 aa27.19■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 PDE8BO95263 885 aa27.18■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 PDE1AP54750 535 aa27.18■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.18■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 CHRNDQ07001 517 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 CACNA1SQ13698 1873 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 MASTLQ96GX5 879 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 H0YIN7 160 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 TIMM10P62072 90 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 STAP2Q9UGK3 403 aa27.17■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.16■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 BBOX1O75936 387 aa27.16■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 ZNF609O15014 1411 aa27.15■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 A0A1B0GUL7 405 aa27.15■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 TAF5LO75529 589 aa27.15■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 ALDH1B1P30837 517 aa27.15■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CTU2-201ENST00000312060 ATP2B3Q16720 1220 aa27.14■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.14■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 GPATCH3Q96I76 525 aa27.14■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.13■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.13■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.12■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 STYK1Q6J9G0 422 aa27.12■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 CHRNA5P30532 468 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 AOX1Q06278 1338 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 FGFR2P21802 821 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 TTC22Q5TAA0 569 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 LPIN2Q92539 896 aa27.11■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.1■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 TMC4Q7Z404 712 aa27.1■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 XAGE2Q96GT9 111 aa27.1■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 ERC2O15083 957 aa27.09■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 PTGER2P43116 358 aa27.09■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.08■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 SNAP23O00161 211 aa27.08■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 SLC5A1P13866 664 aa27.08■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.08■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 SLX4Q8IY92 1834 aa27.08■■□□□ 1.93
CTU2-201ENST00000312060 ADORA1P30542 326 aa27.08■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.08■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 GORABQ5T7V8 394 aa27.08■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 CNKSR1Q969H4 720 aa27.08■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 SP8Q8IXZ3 490 aa27.07■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.07■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 AK9Q5TCS8 1911 aa27.06■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.06■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 UBE4AQ14139 1066 aa27.06■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 SPON1Q9HCB6 807 aa27.06■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 SLC51AQ86UW1 340 aa27.05■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.05■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 KCNJ4P48050 445 aa27.05■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 TGFB2P61812 414 aa27.05■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.05■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 XDHP47989 1333 aa27.04■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 A0A0G2JLW4 131 aa27.04■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 DPEP1P16444 411 aa27.03■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 ATP5JP18859 108 aa27.03■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 BOLA2Q9H3K6 86 aa27.03■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.03■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.02■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 GPSM2P81274 684 aa27.02■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.02■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.01■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.01■■□□□ 1.92
CTU2-201ENST00000312060 SDSP20132 328 aa27.01■■□□□ 1.91
CTU2-201ENST00000312060 KLHL34Q8N239 644 aa27.01■■□□□ 1.91
CTU2-201ENST00000312060 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27■■□□□ 1.91
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