RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299295.6

CHODL-201, Transcript of chondrolectin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHODL, Length 2,548 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHODL-201ENST00000299295 KLHL34Q8N239 644 aa25.99■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.99■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 ZNF609O15014 1411 aa25.99■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 A0A0G2JLW4 131 aa25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 JCADQ9P266 1359 aa25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 FGD1P98174 961 aa25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 ZNF790Q6PG37 636 aa25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.97■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.97■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 USP16Q9Y5T5 823 aa25.97■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.97■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 FBXW7Q969H0 707 aa25.97■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 ATP5JP18859 108 aa25.96■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 GUCY1B3Q02153 619 aa25.95■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.95■■□□□ 1.75
CHODL-201ENST00000299295 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 TNNT1P13805 278 aa25.95■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 APOBRQ0VD83 1088 aa25.94■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 KRT32Q14532 448 aa25.94■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 ANKRD7Q92527 254 aa25.94■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 CHST3Q7LGC8 479 aa25.94■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 CTDNEP1O95476 244 aa25.93■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.93■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 COPRSQ9NQ92 184 aa25.93■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 NCAPD2Q15021 1401 aa25.93■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 TMEM94Q12767 1356 aa25.93■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 IQCB1Q15051 598 aa25.92■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.92■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 ZNF592Q92610 1267 aa25.92■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 USP27XA6NNY8 438 aa25.92■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 USP28Q96RU2 1077 aa25.91■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 CFAP45Q9UL16 551 aa25.9■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.89■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.89■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 IGSF3O75054 1194 aa25.89■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.89■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.89■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.89■■□□□ 1.74
CHODL-201ENST00000299295 GOLIM4O00461 696 aa25.89■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 ATF3P18847 181 aa25.89■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 DMTNQ08495 405 aa25.89■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.89■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 A0A087WZG4 1122 aa25.88■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.88■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 HAUS7Q99871 368 aa25.88■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.88■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.88■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.87■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 PFKFB2O60825 505 aa25.87■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 TIMM10P62072 90 aa25.87■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.87■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 MRC1P22897 1456 aa25.87■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.86■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.86■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.86■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 SMTNL1A8MU46 457 aa25.86■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.85■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.85■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.84■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.84■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 BECN2A8MW95 431 aa25.84■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 ME1P48163 572 aa25.84■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.84■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 C5P01031 1676 aa25.84■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 STX1AQ16623 288 aa25.83■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.83■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.83■■□□□ 1.73
CHODL-201ENST00000299295 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.2 ms