RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp17lcG5E8I7 545 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cd200O54901 278 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tgfb1P04202 390 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sbk3P0C5K0 361 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnf19aP50636 840 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 EnahQ03173 802 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kmt5aQ2YDW7 349 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rftn1Q6A0D4 554 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Klhl23Q6GQU2 558 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lrp12Q8BUJ9 858 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam53cQ8BXQ8 393 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 DymQ8CHY3 669 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CrotQ9DC50 612 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rabgef1Q9JM13 491 aa3.68□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm2056J3QQ02 144 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hap1O35668 628 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mmp20P57748 482 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pnpla5Q32LZ8 432 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Eef2kmtQ3UZW7 335 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bahd1Q497V6 772 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Carns1Q6ZPS2 827 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pcdh19Q80TF3 1145 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bsdc1Q80Y55 427 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bmp3Q8BHE5 468 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mrgprb3Q91ZC1 312 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Capn12Q9ER56 720 aa3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gsg1l2M0QWL6 290 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 RaraP11416 462 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ArsaP50428 506 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Col19a1Q0VF58 1136 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rtkn2Q14B46 604 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ssuh2Q8C3L1 340 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Psmd2Q8VDM4 908 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Deaf1Q9Z1T5 566 aa3.66□□□□□ -1.82
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NpwA0A1L1STR8 176 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gp6P0C191 313 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pde6bP23440 856 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gabpb2P81069 414 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stim2P83093 746 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 P84750 121 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nfatc3P97305 1075 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tnni3kQ5GIG6 834 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dennd6aQ8BH65 605 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MylipQ8BM54 445 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp40Q8BWR4 1235 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Klhl36Q8R124 613 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 1700020D05RikQ99PB1 294 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lce1hQ9D6R3 140 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Adam11Q9R1V4 773 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cldn10Q9Z0S6 231 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa3.65□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stox1B2RQL2 990 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Speer4f2E9Q366 295 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp17lbE9Q9U0 468 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dsg3O35902 993 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Grem1O70326 184 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CtskP55097 329 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wnt10aP70701 417 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Skap2Q3UND0 358 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 EndouQ3V188 412 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sik1Q60670 779 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AgerQ62151 402 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vamp1Q62442 118 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Best3Q6H1V1 669 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trak2Q6P9N8 913 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ccdc154Q6RUT8 657 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kdm4aQ8BW72 1064 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 EngaseQ8BX80 734 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q8C5K5 320 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wipi1Q8R3E3 446 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 SharpinQ91WA6 380 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ankrd1Q9CR42 319 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dmrtc1c1Q9D410 238 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Jam2Q9JI59 298 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnf14Q9JI90 485 aa3.64□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NpcdF8VQB8 469 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tbx3P70324 741 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q3UZV7 1028 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mapk4Q6P5G0 583 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gpbar1Q80SS6 329 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tgif2Q8C0Y1 237 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ints5Q8CHT3 1018 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lmntd1Q9D4C1 413 aa3.63□□□□□ -1.83
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mzb1Q9D8I1 188 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms