RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113343.7

Cldn34c1-201, Transcript of Claudin 34C1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn34c1, Length 3,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Hvcn1Q3U2S8 269 aa15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cadps2Q8BYR5 1297 aa15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 TnksQ6PFX9 1320 aa15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tmem266Q8BZB3 538 aa15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Pnma3Q8JZW8 466 aa15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 ZgpatQ8VDM1 511 aa15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Zkscan7E9PVW1 718 aa15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tyro3P55144 880 aa15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Rdm1Q9CQK3 281 aa15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Zfp317Q8C0Q5 607 aa15.71■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa15.71■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 IncenpQ9WU62 880 aa15.71■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 EzrP26040 586 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Asap2Q7SIG6 958 aa15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Rufy2Q8R4C2 606 aa15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Slc4a1P04919 929 aa15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ccer1Q9CQL2 403 aa15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mx2Q9WVP9 655 aa15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Sos2Q02384 1333 aa15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Lins1Q3U1D0 764 aa15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mknk2Q8CDB0 459 aa15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Kcnq3Q8K3F6 873 aa15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gpatch11Q3UFS4 262 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Fam102bQ8BQS4 339 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cfap58B2RW38 873 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Zkscan8Q8BSL0 588 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Hook1Q8BIL5 728 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ehd4Q9EQP2 541 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Col4a1P02463 1669 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cspp1B2RX88 1205 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 BrapQ99MP8 591 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ftl2P49945 183 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Csrnp1P59054 583 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ccdc162pQ0VG85 912 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gse1Q3U3C9 1213 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ripk4Q9ERK0 786 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ccne2Q9Z238 404 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tnks1bp1P58871 1720 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 NcapgE9PWG6 1004 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 TsksO54887 585 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Pard3Q99NH2 1333 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Wnk3Q80XP9 1757 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Usp28Q5I043 1051 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 ZyxQ62523 564 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ccdc82Q6PG04 518 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gm29094F6Q785 221 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Brinp3Q499E0 766 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 MthfsQ9D110 203 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gpr182P43142 395 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 TrdnE9Q9K5 693 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cavin1O54724 392 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Atp2b3Q0VF55 1220 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Col18a1P39061 1774 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cyp2d34L7N463 504 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Clca2Q8BG22 942 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ciao1Q99KN2 339 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Taok2Q6ZQ29 1240 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Atad2Q8CDM1 1040 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cfap99A0A140LIX9 648 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cfap157Q0VFX2 523 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mctp2Q5RJH2 878 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cep55Q8BT07 462 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mtmr3Q8K296 1196 aa15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ccdc112A0AUP1 442 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cyp19a1P28649 503 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gpatch3Q8BIY1 525 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 AbraQ8BUZ1 375 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cops6O88545 324 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cyp7a1Q64505 503 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ncaph2Q8BSP2 607 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Fsd2Q8BZ52 692 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 LyarQ08288 388 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.3 ms