RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640507.1

SPIN3-240, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	PYURF	Q96I23	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	PTP4A3	O75365	173 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	SNAP29	O95721	258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ITGA2	P17301	1181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	GPR4	P46093	362 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	VLDLR	P98155	873 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NSMAF	Q92636	917 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	SYNGR3	O43761	229 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	SEMG1	P04279	462 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CD14	P08571	375 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ADRA2A	P08913	450 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CCL2	P13500	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NR4A2	P43354	598 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ERVK-25	P63136	954 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	SGCA	Q16586	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ZAN	Q9Y493	2812 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507		M0R233	179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	AHCYL1	O43865	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CRLF1	O75462	422 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	DIRAS1	O95057	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	DAO	P14920	347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF32	P17041	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	RAD52	P43351	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	OMP	P47874	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	LIMS1	P48059	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	MNAT1	P51948	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	HSF2	Q03933	536 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	FUZ	Q9BT04	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-240	ENST00000640507	NDUFB2	O95178	105 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	STAMBP	O95630	424 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	CST2	P09228	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	APLNR	P35414	380 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	UCP2	P55851	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	SMIM11A	P58511	58 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	MXRA7	P84157	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	PSG4	Q00888	419 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	SEC23B	Q15437	767 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	CARTPT	Q16568	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	ZNF786	Q8N393	782 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507		Q96M85	177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-240	ENST00000640507	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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