RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481		B8ZZF3	427 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	OGG1	O15527	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SUSD5	O60279	629 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	LTB	Q06643	244 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SNTA1	Q13424	505 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	VASH2	Q86V25	355 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	RELT	Q969Z4	430 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481		U3KQ87	197 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1B0GVI7	797 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1W2PRG6	482 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481		G3V3Y1	287 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CTDSPL	O15194	276 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	IGF2	P01344	180 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CD1A	P06126	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TPO	P07202	933 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CLU	P10909	449 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	LIPC	P11150	499 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	MSX1	P28360	303 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	FOXF1	Q12946	379 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2M3	Q8NG83	312 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TAAR8	Q969N4	342 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A12	O75746	678 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	RAF1	P04049	648 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CD3G	P09693	182 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	EPX	P11678	715 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	MAP6	Q96JE9	813 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	NANS	Q9NR45	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	TSC22D2	O75157	780 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPB7	O75200	414 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	NDUFB2	O95178	105 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	F10	P00742	488 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	UCHL1	P09936	223 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ATF1	P18846	271 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	GIF	P27352	417 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	LIPH	Q8WWY8	451 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	PHYHIP	Q92561	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-208	ENST00000638481	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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