RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637383.1

SMARCA2-262, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-262	ENST00000637383	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRAM2	Q15035	370 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TAF11	Q15544	211 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM166A	Q6J272	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CBLL1	Q75N03	491 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NRM	Q8IXM6	262 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR51A7	Q8NH64	312 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NSMAF	Q92636	917 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NABP1	Q96AH0	204 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SOX7	Q9BT81	388 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	C1orf198	Q9H425	327 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	RHCG	Q9UBD6	479 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A087WUU8	490 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A1W2PPW3	197 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NDUFAB1	O14561	156 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SERPINA1	P01009	418 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TGFA	P01135	160 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGHM	P01871	453 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	HPX	P02790	462 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NAT2	P11245	290 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NR2C1	P13056	603 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF250	P15622	560 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	COL8A2	P25067	703 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	IL2RG	P31785	369 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	RAD52	P43351	418 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NUDT2	P50583	147 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CHN2	P52757	468 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	UCP2	P55851	309 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SELENOV	P59797	346 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CTXN1	P60606	82 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ERVS71-1	P61550	626 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	HSF2	Q03933	536 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	PLP2	Q04941	152 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	FMOD	Q06828	376 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRIP10	Q15642	601 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SGCA	Q16586	387 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	IFI44L	Q53G44	452 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	THEM4	Q5T1C6	240 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM27B	Q5VT28	67 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	OAF	Q86UD1	273 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF519	Q8TB69	540 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	FNDC8	Q8TC99	324 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	RDH5	Q92781	318 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	HPS1	Q92902	700 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	SNX18	Q96RF0	628 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	ALG12	Q9BV10	488 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR51B6	Q9H340	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CHODL	Q9H9P2	273 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDH20	Q9HBT6	801 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383	GMNC	A6NCL1	334 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-262	ENST00000637383		A6NIZ1	184 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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