RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A0U1RQS6	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A6NJ64	397 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A8MU76	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525		M0R233	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SULT1C2	O00338	296 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR171	O14626	319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FLRT2	O43155	660 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NDUFS4	O43181	175 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HPGDS	O60760	199 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSPAN9	O75954	239 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OPN1SW	P03999	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UCHL1	P09936	223 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IRF1	P10914	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACP5	P13686	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZP3	P21754	424 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNASE1	P24855	282 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD70	P32970	193 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RORA	P35398	523 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLCNKA	P51800	687 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MXD1	Q05195	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STX4	Q12846	297 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BIK	Q13323	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZIC1	Q15915	447 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525		Q5BKY6	102 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COX14	Q96I36	57 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STAC	Q99469	402 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BPTF	Q12830	3046 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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