RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 EPXP11678 715 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MSX1P28360 303 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 INPP1P49441 399 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 HCCSP53701 268 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PLET1Q6UQ28 207 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 LANCL3Q6ZV70 420 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 APCDD1LQ8NCL9 501 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF524Q96C55 264 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA2Q9UM82 520 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 XKRYO14609 159 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 LYRM1O43325 122 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA10O75578 1167 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 AHSA1O95433 338 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT8P05787 483 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZP4Q12836 540 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP78Q5JTW2 689 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FDX2Q6P4F2 183 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRG3Q86Y34 549 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SAMD12Q8N8I0 201 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF519Q8TB69 540 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB17Q8WXJ9 295 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 SHANK1Q9Y566 2161 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPBD1B2RD01 187 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CTDSPLO15194 276 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FZD7O75084 574 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 UBL3O95164 117 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT14O95848 222 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD16AO95870 558 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RAF1P04049 648 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM157BP0CG42 384 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM27D1Q5T7N8 215 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6F1Q8NGZ6 308 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 HGDQ93099 445 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 WACQ9BTA9 647 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF221Q9UK13 617 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM72A0PK05 275 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 F13BP05160 661 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKCAP17252 672 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ALOX5APP20292 161 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 EMP2P54851 167 aa22.8■■□□□ 1.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR4M1Q8NGD0 313 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RFT1Q96AA3 541 aa22.8■■□□□ 1.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF208O43345 1280 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 UPK3AO75631 287 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10A3P58181 314 aa22.79■■□□□ 1.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR6V1Q8N148 313 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMP5Q9UJQ1 280 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa22.78■■□□□ 1.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 A6NIZ1 184 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SCO2O43819 266 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC43A1O75387 559 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN20P56880 219 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RAP1BP61224 184 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RAP1AP62834 184 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF511Q8NB15 262 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MARVELD1Q9BSK0 173 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SLITRK2Q9H156 845 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMK2AQ9UQM7 478 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS37A4D1T9 235 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6A2O95222 327 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SRMP19623 302 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA3P26006 1051 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP15P51511 669 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 BTG1P62324 171 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa22.77■■□□□ 1.24
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