RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CCNIQ14094 377 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RAB39AQ14964 217 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ADIPOQQ15848 244 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MST1LQ2TV78 715 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC36A2Q495M3 483 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FGD3Q5JSP0 725 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 OAFQ86UD1 273 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NRMQ8IXM6 262 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC18Q8N456 261 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF525Q8N782 197 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NUP37Q8NFH4 326 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ASB10Q8WXI3 467 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FAM168AQ92567 244 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NSMAFQ92636 917 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MCHR2Q969V1 340 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RBP7Q96R05 134 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 Q9H521 79 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NOX3Q9HBY0 568 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CMAHPQ9Y471 501 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 V9GYQ6 96 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WUU8 490 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FFAR1O14842 300 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PDE5AO76074 875 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A10O95528 541 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PTHP01270 115 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA5P05154 406 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TFAP2AP05549 437 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM18P0DKX4 95 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NR2C1P13056 603 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NR4A1P22736 598 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 PDLIM4P50479 330 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HSF2Q03933 536 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PRKCDQ05655 676 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 EFNB3Q15768 340 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SGCAQ16586 387 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF627Q7L945 461 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SVOPLQ8N434 492 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LIPHQ8WWY8 451 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CDRT15Q96T59 188 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CDH20Q9HBT6 801 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CENPBD1B2RD01 187 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 INAFM1C9JVW0 142 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 H3BNX3 289 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ADRA2AP08913 450 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CSF3P09919 207 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CCL2P13500 99 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A16P16260 332 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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