RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR8B4Q96RC9 309 aa25.95■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SMURF1Q9HCE7 757 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa25.94■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NPIPA3F8WFD2 350 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 AQP8O94778 261 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRKAR1AP10644 381 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSKH1P11801 424 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLDN20P56880 219 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CARD18P57730 90 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCK2Q16822 640 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 HBMQ6B0K9 141 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 C16orf87Q6PH81 154 aa25.94■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TTTY12Q9BZ98 90 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF4O00268 1085 aa25.94■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CREB3L2Q70SY1 520 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF679Q8IYX0 411 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2V1Q8NHB1 315 aa25.94■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ROM1Q03395 351 aa25.93■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST3H3Q16695 136 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MEP1BQ16820 701 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRILQ7L0X0 811 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR9K2Q8NGE7 335 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC39A7Q92504 469 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHYHIPQ92561 330 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRG7Q96K78 797 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MROQ9BYG7 248 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF281Q9Y2X9 895 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED12Q93074 2177 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYL9P24844 172 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CALRP27797 417 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 LAP3P28838 519 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF45Q02386 682 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC17A1Q14916 467 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa25.92■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR10H5Q8NGA6 315 aa25.92■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa25.92■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HYAL4Q2M3T9 481 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 YIF1BQ5BJH7 314 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZMAT1Q5H9K5 638 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABHD6Q9BV23 337 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIGARQ9NQ88 270 aa25.91■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DVL2O14641 736 aa25.91■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MEOX1P50221 254 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARG2P78540 354 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT77Q7Z794 578 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52N5Q8NH56 324 aa25.91■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP19Q96LK0 163 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.745e-26■■□□□ 14.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 H0YC42 278 aa25.9■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CD40LGP29965 261 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 STARP49675 285 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLN3Q13286 438 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CARD17Q5XLA6 110 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 FDX2Q6P4F2 183 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBQLNLQ8IYU4 475 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 QPCTLQ9NXS2 382 aa25.9■■□□□ 1.74
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