RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 CFHR1Q03591 330 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 FMODQ06828 376 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF626Q68DY1 528 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR8B4Q96RC9 309 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ETV7Q9Y603 341 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 PRSS37A4D1T9 235 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 POM121CA8CG34 1229 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 CD3DP04234 171 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 GTF2F2P13984 249 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 IFNGR1P15260 489 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ABCD3P28288 659 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 H2BFSP57053 126 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 EGR3Q06889 387 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 CDH24Q86UP0 819 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TTC9Q92623 222 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 SFXN2Q96NB2 322 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 H3BMH7 237 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 H7C417 338 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 IFNA7P01567 189 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 PDGFAP04085 211 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 FOLR1P15328 257 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 EMC4Q5J8M3 183 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 GKN2Q86XP6 184 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ADGRG3Q86Y34 549 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 MSANTD3Q96H12 275 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 MED30Q96HR3 178 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 FITM1A5D6W6 292 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 LILRA5A6NI73 299 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 GP1BBP13224 206 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 RHPN2P1A8MT19 583 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ARPC5O15511 151 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TSPAN2O60636 221 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 RAB30Q15771 203 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 KRT77Q7Z794 578 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 CTSFQ9UBX1 484 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 A0A1W2PR77 199 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 PLSCR5A0PG75 271 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 OR2M5A3KFT3 312 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 SHISA8B8ZZ34 492 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF35P13682 527 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ARL4DP49703 201 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ABHD6Q9BV23 337 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 FRYLO94915 3013 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 L7N2F9 121 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 IGF2P01344 180 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 SPOCK1Q08629 439 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 CORO6Q6QEF8 472 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 EID2Q8N6I1 236 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF519Q8TB69 540 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 STK35Q8TDR2 534 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms