RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904		E9PQ18	207 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	DCTN6	O00399	190 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SEC14L2	O76054	403 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	GLCE	O94923	617 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ITGA5	P08648	1049 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	GNAO1	P09471	354 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF823	P16415	610 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	MSR1	P21757	451 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	PYCR1	P32322	319 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	UGT2B10	P36537	528 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	CAPZA2	P47755	286 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SGCA	Q16586	387 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	KRT80	Q6KB66	452 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	DDO	Q99489	341 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	DOCK7	Q96N67	2140 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A096LPE4	126 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PPZ6	126 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	TMCC2	O75069	709 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	CLU	P10909	449 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	PPP3CB	P16298	524 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	GSTT1	P30711	240 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	HTR1F	P30939	366 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	CDA	P32320	146 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ATP6V1E1	P36543	226 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	PEX19	P40855	299 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	PCBD1	P61457	104 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ADAM8	P78325	824 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	EFNB1	P98172	346 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SORD	Q00796	357 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	HSF2	Q03933	536 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	POU4F2	Q12837	409 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	TMED1	Q13445	227 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ETFDH	Q16134	617 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	OCLN	Q16625	522 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC36A2	Q495M3	483 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF627	Q7L945	461 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	POLE	Q07864	2286 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	ENTPD6	O75354	484 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	WNT11	O96014	354 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	HRG	P04196	525 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	MYF6	P23409	242 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	TEK	Q02763	1124 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	GABRA6	Q16445	453 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM27B	Q5VT28	67 aa		10.98	□□□□□ -0.65

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