RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.071e-12■■■■■ 34.1
CS-217ENST00000550044 USF3Q68DE3 2245 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 QDPRP09417 244 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TSPAN19P0C672 248 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PGA4P0DJD7 388 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PGA3P0DJD8 388 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ACADSP16219 412 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CD40P25942 277 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RRM2P31350 389 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CAPZA2P47755 286 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 OMPP47874 163 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CLRN1P58418 232 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SMIM11AP58511 58 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PIGFQ07326 219 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SPOCK1Q08629 439 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 BNIP1Q12981 228 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZBED5Q49AG3 693 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LCN8Q6JVE9 175 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 Q6ZS46 218 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ASB10Q8WXI3 467 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HTRA1Q92743 480 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RADILQ96JH8 1075 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LRGUKQ96M69 825 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF347Q96SE7 839 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MUC13Q9H3R2 512 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 AURKCQ9UQB9 309 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SHISA9B4DS77 424 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ACOT8O14734 319 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HS3ST1O14792 307 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 DHHO43323 396 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 OR10H3O60404 316 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PTP4A3O75365 173 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 STAMBPO95630 424 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 IGHG1P01857 330 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PATE4P0C8F1 98 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CD79AP11912 226 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 B4GALT1P15291 398 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PTAFRP25105 342 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ACVR1BP36896 505 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SLC9A3P48764 834 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ERFP50548 548 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ERVK-25P63136 954 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CHRNB3Q05901 458 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MTX3Q5HYI7 312 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SLC22A25Q6T423 547 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SSX8Q7RTT4 187 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MCHR2Q969V1 340 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ASB9Q96DX5 294 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 BOD1Q96IK1 185 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 GPA33Q99795 319 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 FOXB1Q99853 325 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 FUZQ9BT04 418 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 UNC119BA6NIH7 251 aa8.36□□□□□ -1.07
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