RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 RHCGQ9UBD6 479 aa6.56□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.56□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.56□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 HSPB2A8KAH6 182 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 LRRN3E7EW58 273 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TSPAN4O14817 238 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TNFSF13O75888 250 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 PDE5AO76074 875 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 AKR7A3O95154 331 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 RCBTB2O95199 551 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 SYNGR4O95473 234 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 SERPINA1P01009 418 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 IFNA2P01563 188 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 UQCRBP14927 111 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 EDNRAP25101 427 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 CHRNB4P30926 498 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 PTGER4P35408 488 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TIMP3P35625 211 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 CPOXP36551 454 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 ERFP50548 548 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 CDH12P55289 794 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 CBX1P83916 185 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 EGR4Q05215 589 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 CEACAM7Q14002 265 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 OR7A5Q15622 319 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 HSPB2Q16082 182 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 BAK1Q16611 211 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 GLYATQ6IB77 296 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 XKRXQ6PP77 449 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 CCDC80Q76M96 950 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 FCRLAQ7L513 359 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.55□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.55□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.55□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.55□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 A0A1W2PNV4 684 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 GJE1A6NN92 205 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 A6NNC1 897 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 DIRAS1O95057 198 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 IGHV3-9P01782 118 aa6.54□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 GGT1P19440 569 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ELK4P28324 431 aa6.54□□□□□ -1.36
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UBE2B-204ENST00000504431 SELENOWP63302 87 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 VEZF1Q14119 521 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TSC22D1Q15714 1073 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 NRF1Q16656 503 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM99Q8N816 258 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 LINC01560Q8TB33 94 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ASB5Q8WWX0 329 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 PROX1Q92786 737 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 TAAR8Q969N4 342 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 STARD4Q96DR4 205 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF559Q9BR84 538 aa6.54□□□□□ -1.36
UBE2B-204ENST00000504431 RNF122Q9H9V4 155 aa6.54□□□□□ -1.36
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