RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PTH	P01270	115 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNW1	P05000	195 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LYNX1	P0DP58	116 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF250	P15622	560 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MAK	P20794	623 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNA8	P32881	189 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDH3B1	P43353	468 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CHN2	P52757	468 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKCD	Q05655	676 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FMOD	Q06828	376 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAM2	Q15035	370 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC18	Q8N456	261 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	HPS1	Q92902	700 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf159	Q96HA4	380 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH20	Q9HBT6	801 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FZR1	Q9UM11	496 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	HPX	P02790	462 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM157B	P0CG42	384 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NR2C1	P13056	603 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IL2RG	P31785	369 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CDA	P32320	146 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GSK3B	P49841	420 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIP10	Q15642	601 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NRM	Q8IXM6	262 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG12	Q9BV10	488 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RHCG	Q9UBD6	479 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP13	Q9UII6	198 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DYSF	O75923	2080 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WUU8	490 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GMNC	A6NCL1	334 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	WIPF1	O43516	503 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NCR1	O76036	304 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CLPTM1	O96005	669 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	COL8A2	P25067	703 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A3	P48764	834 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	UCP2	P55851	309 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CTXN1	P60606	82 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVS71-1	P61550	626 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PLP2	Q04941	152 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CD47	Q08722	323 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IFI44L	Q53G44	452 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	THEM4	Q5T1C6	240 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF519	Q8TB69	540 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FNDC8	Q8TC99	324 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFAB1	O14561	156 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF682	O95780	498 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINA1	P01009	418 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NAT2	P11245	290 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF32	P17041	273 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ACHE	P22303	614 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RAD52	P43351	418 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM27B	Q5VT28	67 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51A7	Q8NH64	312 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NSMAF	Q92636	917 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RDH5	Q92781	318 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PPW3	197 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC42EP2	O14613	210 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGA2	P17301	1181 aa		15.15	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms