RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HPGDP15428 266 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLK2P20151 261 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HTR1EP28566 365 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NBL1P41271 181 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNFSF9P41273 254 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CAV2P51636 162 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TIMM10P62072 90 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SP4Q02446 784 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TWF1Q12792 350 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GGTLC2Q14390 218 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLINT1Q14677 625 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF726P1Q15940 193 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SGCAQ16586 387 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM122BQ7Z309 247 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CMTM8Q8IZV2 173 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PDCL2Q8N4E4 241 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TOP1MTQ969P6 601 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ASB9Q96DX5 294 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 P2RX4Q99571 388 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ECSITQ9BQ95 431 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ACP6Q9NPH0 428 aa3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DUX4Q9UBX2 424 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A1W2PRD5 423 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM120BA0PK00 339 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LYRM9A8MSI8 78 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SERPINE3A8MV23 424 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HIDE1A8MVS5 230 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 H0YHG0 523 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FKBP6O75344 327 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CSTAP01040 98 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HPNP05981 417 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLTAP09496 248 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 HRH1P35367 487 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ETV1P50549 477 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMED1Q13445 227 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NCF4Q15080 339 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC1A5Q15758 541 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 SERPINB12Q96P63 405 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A1W2PPV4 95 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PRSS37A4D1T9 235 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SMKR1H3BMG3 65 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 H3BNH8 94 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPOPO43791 374 aa3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-1339P-201ENST00000363574 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TGM6O95932 706 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MBP02144 154 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CT45A6P0DMU7 189 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CT45A5P0DMU8 189 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CT45A7P0DMV0 189 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CTRLP40313 264 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NUP107P57740 925 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MXD1Q05195 221 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PSMD5Q16401 504 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IL17AQ16552 155 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OTPQ5XKR4 325 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPINK14Q6IE38 97 aa3.21□□□□□ -1.9
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