RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 TMCC3Q9ULS5 477 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SLC22A23A1A5C7 686 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R3DO95685 299 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SCG5P05408 212 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NR2C1P13056 603 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF35P13682 527 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SDHAP31040 664 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 THBS4P35443 961 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 HMGA2P52926 109 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 BNIP1Q12981 228 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DAG1Q14118 895 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ADIPOQQ15848 244 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SGCAQ16586 387 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MSMPQ1L6U9 139 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SWI5Q1ZZU3 235 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf94Q6P1W5 598 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCD3Q6STE5 483 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FOXN4Q96NZ1 517 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NDEL1Q9GZM8 345 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RNF121Q9H920 327 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SIAEQ9HAT2 523 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPL8 197 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS37A4D1T9 235 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SOCS2O14508 198 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 XKRYO14609 159 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GPRIN2O60269 458 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MGRN1O60291 552 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ENTPD5O75356 428 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 KRT36O76013 467 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TXNDC12O95881 172 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINA5P05154 406 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR4A8P0C604 315 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CCL2P13500 99 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CTLA4P16410 223 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF32P17041 273 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ERFP50548 548 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TSPAN31Q12999 210 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RFX4Q33E94 735 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SLC36A2Q495M3 483 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OTPQ5XKR4 325 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GPR139Q6DWJ6 353 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T5Q6IEZ7 315 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM53Q6P2H8 277 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF620Q6ZNG0 422 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 IL17RDQ8NFM7 739 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T29Q8NH02 315 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FNDC8Q8TC99 324 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CANT1Q8WVQ1 401 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD8Q96LT4 415 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 U3KQV3 271 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 DHRS12A0PJE2 317 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 AQP12BA6NM10 295 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 H7C1Q1 480 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GSC2O15499 205 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CCNB2O95067 398 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 STAMBPO95630 424 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GASTP01350 101 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RAP2AP10114 183 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NPR2P20594 1047 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NR4A1P22736 598 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 LAP3P28838 519 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINF1P36955 418 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 IFNGR2P38484 337 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RPS6KA3P51812 740 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 FLOT2Q14254 428 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 DPPA2Q7Z7J5 298 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 AQP12AQ8IXF9 295 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SLC30A7Q8NEW0 376 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SMR3AQ99954 134 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CHID1Q9BWS9 393 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM15Q9C019 465 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SYT4Q9H2B2 425 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF442Q9H7R0 627 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 POLE4Q9NR33 117 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL3Q9UKT7 428 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 POMPQ9Y244 141 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 H7C417 338 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SLC6A6P31641 620 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms