RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Frg2f1Q6P3A2 227 aa14.19□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rab40bQ8VHP8 278 aa14.19□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trex2Q9R1A9 236 aa14.19□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ch25hQ9Z0F5 298 aa14.19□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nfatc1O88942 717 aa14.19□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mitd1Q8VDV8 249 aa14.19□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Col2a1P28481 1487 aa14.19□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem200cJ3QK46 637 aa14.19□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Adprhl1Q8BGK2 353 aa14.19□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Txnl1Q8CDN6 289 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SpartQ8R1X6 671 aa14.18□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rab19P35294 217 aa14.18□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Acod1P54987 488 aa14.18□□□□□ -0.14
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fut7Q11131 389 aa14.18□□□□□ -0.14
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cxcl5P50228 132 aa14.18□□□□□ -0.14
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