RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM80Q96HE8 168 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 RBP7Q96R05 134 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 OR2M2Q96R28 347 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TM9SF2Q99805 663 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SYT4Q9H2B2 425 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ASB6Q9NWX5 421 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MED29Q9NX70 200 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 CACNA1CQ13936 2221 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 A0A1B0GTH9 108 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM129A0AVI4 362 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SLC35F4A4IF30 521 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 HSPB2A8KAH6 182 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PHYHO14832 338 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 RAMP1O60894 148 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SERPINI2O75830 405 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 CLPTM1O96005 669 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 HTR1AP08908 422 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SBK2P0C263 348 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MYL12AP19105 171 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 GSTT1P30711 240 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TTKP33981 857 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PTGS2P35354 604 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 CSNK1A1P48729 337 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 NUDT6P53370 316 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 NR1H2P55055 460 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 CLDN17P56750 224 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PRR20EP86478 221 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PRR20CP86479 221 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PRR20DP86480 221 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PRR20BP86481 221 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PRR20AP86496 221 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SRYQ05066 204 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 RBPJQ06330 500 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ST3GAL4Q11206 333 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 BLMHQ13867 455 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 IRF3Q14653 427 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 GUSBP1Q15486 140 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 HSPB2Q16082 182 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 KCNMB1Q16558 191 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 NRN1LQ496H8 165 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 KLHL12Q53G59 568 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TEX30Q5JUR7 227 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 OR6V1Q8N148 313 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 KDM8Q8N371 416 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 LGALS12Q96DT0 336 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TXNDC15Q96J42 360 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 WACQ9BTA9 647 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MED20Q9H944 212 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 GLTPQ9NZD2 209 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 AASSQ9UDR5 926 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 B9D1Q9UPM9 204 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 PTGES3LE9PB15 166 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 SLC16A7O60669 478 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5B-210ENST00000602511 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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