RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680	PAX1	P15863	534 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	TTK	P33981	857 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	MAGEA2	P43356	314 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	PTH2R	P49190	550 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	RASSF2	P50749	326 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	HMGA2	P52926	109 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	RAB1A	P62820	205 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	BNIP1	Q12981	228 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	LINC00471	Q8N535	108 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	OVOL3	O00110	214 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	AHCYL1	O43865	530 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC2A10	O95528	541 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	RAP2A	P10114	183 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	NPR2	P20594	1047 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	FPR3	P25089	353 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	ADAM8	P78325	824 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	FMOD	Q06828	376 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	MUC15	Q8N387	334 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	NSMAF	Q92636	917 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680		Q96M85	177 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	RNF121	Q9H920	327 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEURL4-208	ENST00000572680	CD8A	P01732	235 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	CALCR	P30988	508 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	SDHA	P31040	664 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	GIPR	P48546	466 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	GSS	P48637	474 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	ATP5J2	P56134	94 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680		Q5PR19	223 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	GPA33	Q99795	319 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	REEP1	Q9H902	201 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	GSC2	O15499	205 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	CCNB2	O95067	398 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	PTH	P01270	115 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	BMP4	P12644	408 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC6A6	P31641	620 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	CDA	P32320	146 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	CDKN1A	P38936	164 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	FLOT2	Q14254	428 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	RAB39A	Q14964	217 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	SGCA	Q16586	387 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	RFX4	Q33E94	735 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	MEST	Q5EB52	335 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NEURL4-208	ENST00000572680	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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