RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 ESM1Q9NQ30 184 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 IFNKQ9P0W0 207 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 MDFICQ9P1T7 246 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 GALPQ9UBC7 116 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 PSMD13Q9UNM6 376 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 SPTA1P02549 2419 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-208ENST00000560725 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 ARGFXA6NJG6 315 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 C2orf74A8MZ97 194 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 EPM2AB3EWF7 344 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 C9J4A7 227 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 E7EQ34 232 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 H7C423 109 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 SDHDO14521 159 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 AGTP01019 485 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 APOC2P02655 101 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 DRD5P21918 477 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 RORAP35398 523 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 EMDP50402 254 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 MFAP2P55001 183 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 DYNLT1P63172 113 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 TATDN3Q17R31 274 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 RAB43Q86YS6 212 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 HAUS1Q96CS2 278 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 C4orf36Q96KX1 117 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 COPS8Q99627 209 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 CHP1Q99653 195 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 TTYH2Q9BSA4 534 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 AMBNQ9NP70 447 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 ATMQ13315 3056 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 H7C0C1 242 aa4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 PRLHRP49683 370 aa4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 PPP1CAP62136 330 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 XIAPP98170 497 aa4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 CES3Q6UWW8 571 aa4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-208ENST00000560725 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 AKR1E2Q96JD6 320 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-208ENST00000560725 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.7□□□□□ -1.66
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