RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 TRANK1O15050 2925 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CEP290O15078 2479 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PQD3 144 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TMEM221A6NGB7 291 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SNTNA6NMZ2 147 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MCIDASD6RGH6 385 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 M0R296 226 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RRHO14718 337 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF264O43296 627 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ICOSLGO75144 302 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ALOX12BO75342 701 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SCRG1O75711 98 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NDUFB2O95178 105 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R3DO95685 299 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 IGF2P01344 180 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 TSPAN19P0C672 248 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 SLC2A5P22732 501 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SOX3P41225 446 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SERPINB10P48595 397 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF84P51523 738 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PNLIPRP2P54317 469 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 IFITM3Q01628 133 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF117Q03924 483 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 EGR4Q05215 589 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ACSM1Q08AH1 577 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TMED1Q13445 227 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CRMP1Q14194 572 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF846Q147U1 533 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF404Q494X3 552 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CEP78Q5JTW2 689 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 WBP2NLQ6ICG8 309 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 LHFPL3Q86UP9 236 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TMEM99Q8N816 258 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 APCDD1LQ8NCL9 501 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 CEP76Q8TAP6 659 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TEAD3Q99594 435 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TEX12Q9BXU0 123 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MMP27Q9H306 513 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 C12orf10Q9HB07 376 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SEC14L4Q9UDX3 406 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.87□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.87□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 A0A075B6Q4 140 aa4.86□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 IDSB3KWA1 339 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 B4DXG7 233 aa4.86□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 MYL12BO14950 172 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ARPC3O15145 178 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 BGLAPP02818 100 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HEXBP07686 556 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SBK2P0C263 348 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SP9P0CG40 484 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PNMTP11086 282 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CCL4P13236 92 aa4.86□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
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