RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 H7C1Q1 480 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 GADD45GO95257 159 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RPL4P36578 427 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ERVK-25P63136 954 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 CHRNB3Q05901 458 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 MST1LQ2TV78 715 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 FAM205BPQ63HN1 556 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 VHLLQ6RSH7 139 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 CLDN22Q8N7P3 220 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 NUP37Q8NFH4 326 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 FBXO17Q96EF6 278 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 IL1RAPQ9NPH3 570 aa18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 A6NIZ1 184 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 PTP4A3O75365 173 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 PDE5AO76074 875 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 INHBBP09529 407 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 NR2C1P13056 603 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SERPINF1P36955 418 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RAP1BP61224 184 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RAP1AP62834 184 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RAB39AQ14964 217 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ADIPOQQ15848 244 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ETFDHQ16134 617 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SWI5Q1ZZU3 235 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 NRN1LQ496H8 165 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 NSMAFQ92636 917 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RBP7Q96R05 134 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 TAS2R1Q9NYW7 299 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 AURKCQ9UQB9 309 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SIGLEC7Q9Y286 467 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa18.93■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 UNC119BA6NIH7 251 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 CD14P08571 375 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 OR4A8P0C604 315 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RRM2P31350 389 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 CDAP32320 146 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 THBS4P35443 961 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 MTX3Q5HYI7 312 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 THEM4Q5T1C6 240 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 DHFR2Q86XF0 187 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 FNDC8Q8TC99 324 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 NDEL1Q9GZM8 345 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 MUC13Q9H3R2 512 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ZNF442Q9H7R0 627 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RNF121Q9H920 327 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 GRHPRQ9UBQ7 328 aa18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 H7C417 338 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 NDUFB2O95178 105 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 BMP4P12644 408 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ZNF35P13682 527 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 MS4A2Q01362 244 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 DAG1Q14118 895 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SLC36A2Q495M3 483 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 LCN8Q6JVE9 175 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 KRT80Q6KB66 452 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ZNF584Q8IVC4 421 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 LRRC18Q8N456 261 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 Q96M85 177 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 GPA33Q99795 319 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SMR3AQ99954 134 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 C1orf21Q9H246 121 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SIAEQ9HAT2 523 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa18.91■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 H7C1C5 153 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SSX4O60224 188 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SERPINA5P05154 406 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 NR4A1P22736 598 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 LCN6P62502 163 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 TNK1Q13470 666 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 RAB35Q15286 201 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 SGCAQ16586 387 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 FAM122BQ7Z309 247 aa18.9■□□□□ 0.62
PUS1-211ENST00000544662 ZER1Q7Z7L7 766 aa18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms