RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALG12Q9BV10 488 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TIMM21Q9BVV7 248 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM59Q9BXS4 323 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT15Q9NV35 164 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXC10Q9NYD6 342 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MPDZO75970 2070 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LAMA3Q16787 3333 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EML5Q05BV3 1969 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MYBPHLA2RUH7 354 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LEUTXA8MZ59 168 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBTB14O43829 449 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGLV3-25P01717 112 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD8AP01732 235 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPRR2EP22531 72 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AQP2P41181 271 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASIC1P78348 528 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RUNX1Q01196 453 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AP1B1Q10567 949 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CEBPEQ15744 281 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMU1Q2TAY7 513 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCTD16Q68DU8 428 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C16orf87Q6PH81 154 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LANCL3Q6ZV70 420 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDH26Q8IXH8 852 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNX31Q8N9S9 440 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR7G3Q8NG95 312 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SH3GL3Q99963 347 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC30A2Q9BRI3 323 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF167Q9H6Y7 350 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA7Q9P0W8 599 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STAP1Q9ULZ2 295 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DYSFO75923 2080 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CACNA1HO95180 2353 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHD8Q9HCK8 2581 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAT3Q8TDW7 4589 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM74A7A6NL05 159 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HIP1O00291 1037 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLA2G10O15496 165 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC19A2O60779 497 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACSM4P0C7M7 580 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IL9P15248 144 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDKN2BP42772 138 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAGEA8P43361 318 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BDKRB1P46663 353 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LGALS7P47929 136 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC6A8P48029 635 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRLHRP49683 370 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATP1B3P54709 279 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXC5Q00444 222 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HES1Q14469 280 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PON3Q15166 354 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM74A3Q4VXF1 159 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA1Q5VX52 437 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF546Q86UE3 836 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VPS36Q86VN1 386 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRSS58Q8IYP2 241 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZADH2Q8N4Q0 377 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STKLD1Q8NE28 680 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C19orf18Q8NEA5 215 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TTLQ8NG68 377 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR4K14Q8NGD5 310 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR6N1Q8NGY5 312 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR4S2Q8NH73 311 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RORBQ92753 470 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CMTM7Q96FZ5 175 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEC22AQ96IW7 307 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRORYQ9H606 182 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRPV5Q9NQA5 729 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C1orf123Q9NWV4 160 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCNIP1Q9NZI2 227 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COPS7AQ9UBW8 275 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FREM1Q5H8C1 2179 aa-1.21□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms