RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515838.2

RBM4-209, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 2

Gene RBM4, Length 943 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-209	ENST00000515838	ACADS	P16219	412 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	ACHE	P22303	614 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	KDELR2	P33947	212 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	RAD52	P43351	418 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	UGT2B15	P54855	530 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	MELK	Q14680	651 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	RAB39A	Q14964	217 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	FAM209A	Q5JX71	171 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	DEF8	Q6ZN54	512 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	C10orf82	Q8WW14	230 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	ASB10	Q8WXI3	467 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	RDH5	Q92781	318 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	MCHR2	Q969V1	340 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	C1orf159	Q96HA4	380 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	PRRC1	Q96M27	445 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	RNF121	Q9H920	327 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	SIAE	Q9HAT2	523 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	CDH20	Q9HBT6	801 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	MED4	Q9NPJ6	270 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM4-209	ENST00000515838		A0A1W2PPW3	197 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	LILRA1	O75019	489 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	MT-ND5	P03915	603 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	TMEM33	P57088	247 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SELENOW	P63302	87 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF519	Q8TB69	540 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SNX33	Q8WV41	574 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	TF	P02787	698 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	F13B	P05160	661 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF250	P15622	560 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	CDH15	P55291	814 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SCGB2A2	Q13296	93 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	MICU2	Q8IYU8	434 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	PFN4	Q8NHR9	129 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SYT3	Q9BQG1	590 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	WAC	Q9BTA9	647 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838		B4DSR2	109 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838		H3BSA7	217 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	IGHM	P01871	453 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	IFNW1	P05000	195 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	APLNR	P35414	380 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	AQP2	P41181	271 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SLC9A3	P48764	834 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	TEK	Q02763	1124 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	HSF2	Q03933	536 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ALG10	Q5BKT4	473 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	THEM4	Q5T1C6	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	TEX29	Q8N6K0	151 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	RBP7	Q96R05	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	SNX18	Q96RF0	628 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF347	Q96SE7	839 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM4-209	ENST00000515838	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36

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