RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512554.1

GCSHP1-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP1, Length 484 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP1-201ENST00000512554 ETV1P50549 477 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CLDN15P56746 228 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CLDN18P56856 261 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 HSF1Q00613 529 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC17A1Q14916 467 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 NEDD8Q15843 81 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 INAQ16352 499 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TIGD6Q17RP2 521 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CDONQ4KMG0 1287 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF766Q5HY98 468 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 THEM4Q5T1C6 240 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 VASNQ6EMK4 673 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LEG1Q6P5S2 330 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CDC20BQ86Y33 519 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TIGD4Q8IY51 512 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR6V1Q8N148 313 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TMEM99Q8N816 258 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SMPDL3BQ92485 455 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TMEM45BQ96B21 275 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ISOC1Q96CN7 298 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RASD2Q96D21 266 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OPALINQ96PE5 141 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR5M11Q96RB7 305 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 COQ7Q99807 217 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GP6Q9HCN6 339 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 KLHL1Q9NR64 748 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 B9D1Q9UPM9 204 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RCE1Q9Y256 329 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 APC2O95996 2303 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CACNA1GO43497 2377 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF716A6NP11 495 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 H3BMQ9 156 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 K7ENP7 123 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 DCTN6O00399 190 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CCRL2O00421 344 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PHYHO14832 338 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MYL12BO14950 172 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC22A1O15245 554 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GMFGO60234 142 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CYTIPO60759 359 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SULT1C4O75897 302 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 AKR7A3O95154 331 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TFP02787 698 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PGA4P0DJD7 388 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PGA3P0DJD8 388 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TFPIP10646 304 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CLUP10909 449 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 HLA-DOBP13765 273 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GDF1P27539 372 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 UGT2B10P36537 528 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ACVR1BP36896 505 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MEOX1P50221 254 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MLLT10P55197 1068 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TAS2R43P59537 309 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ARG2P78540 354 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF85Q03923 595 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC10A1Q14973 349 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SSX1Q16384 188 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GXYLT1Q4G148 440 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CCDC58Q4VC31 144 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 C10orf128Q5T292 105 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RAET1LQ5VY80 246 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms