RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NPRL3Q12980 569 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 BNIP1Q12981 228 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 SHEQ5VZ18 495 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ZNF544Q6NX49 715 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 THSD4Q6ZMP0 1018 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 SH3GL3Q99963 347 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 TMCC3Q9ULS5 477 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa18.19■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 OR10H3O60404 316 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 UBL3O95164 117 aa18.18■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 FABP6P51161 128 aa18.18■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 CD47Q08722 323 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 NRN1LQ496H8 165 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 THEM4Q5T1C6 240 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 AGAP6Q5VW22 663 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 C11orf71Q6IPW1 123 aa18.18■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 Q96M85 177 aa18.18■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 PRSS57Q6UWY2 283 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 FBXL14Q8N1E6 418 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 OR4C15Q8NGM1 316 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 FNDC8Q8TC99 324 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 GRHPRQ9UBQ7 328 aa18.17■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 CDAP32320 146 aa18.16■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 NABP1Q96AH0 204 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 TRIM15Q9C019 465 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 SIAEQ9HAT2 523 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A23A1A5C7 686 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 AQP12BA6NM10 295 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 H7C1C5 153 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 GSC2O15499 205 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 MGRN1O60291 552 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 RAP2AP10114 183 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 IFNGR2P38484 337 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ATP5J2P56134 94 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 LCN6P62502 163 aa18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-211ENST00000480301 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ZNF584Q8IVC4 421 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ADGRG5Q8IZF4 528 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 NUP37Q8NFH4 326 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 OR4F15Q8NGB8 312 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ZNF570Q96NI8 536 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 CA10Q9NS85 328 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 VNN3Q9NY84 501 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa18.15■□□□□ 0.5
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