RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466154.5

SLX4-202, Transcript of SLX4 structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLX4, Length 3,228 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4-202ENST00000466154 FTMTQ8N4E7 242 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 EXD3Q8N9H8 876 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 C5orf34Q96MH7 638 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 EMC6Q9BV81 110 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 MED11Q9P086 117 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 B9D1Q9UPM9 204 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.76□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 AHSA1O95433 338 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 PNPP00491 289 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 CSN2P05814 226 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 KIR3DL2P43630 455 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 SLC6A8P48029 635 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 BLVRAP53004 296 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 AP3S2P59780 193 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 TSPAN5P62079 268 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 SNTA1Q13424 505 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 MED29Q9NX70 200 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 PRSS37A4D1T9 235 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 SIX6O95475 246 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 BGLAPP02818 100 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 POU3F4P49335 361 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 HACD4Q5VWC8 232 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 OR10K2Q6IF99 312 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ARL5BQ96KC2 179 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 RTTNQ86VV8 2226 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ABHD16AO95870 558 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ALDOBP05062 364 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 SPOCK1Q08629 439 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ANGPT1Q15389 498 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 OTOSQ8NHW6 89 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 GINS4Q9BRT9 223 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ADAM19Q9H013 955 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 EMC7Q9NPA0 242 aa14.75□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 MBTPS2O43462 519 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 NXPH1P58417 271 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ZP1P60852 638 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 C8orf44Q96CB5 159 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 HAVCR1Q96D42 359 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 OR1F2PQ96R84 312 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 MUC3AQ02505 3323 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 TMEM212A6NML5 194 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 RBBP9O75884 186 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 GTF2F2P13984 249 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 CAMK2BQ13554 666 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 DYRK1AQ13627 763 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ISXQ2M1V0 245 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 MIB2Q96AX9 1013 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 C4orf45Q96LM5 186 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 DLL4Q9NR61 685 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 DHDHQ9UQ10 334 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.74□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 A0A1B0GX78 115 aa14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 FITM1A5D6W6 292 aa14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 ITGA5P08648 1049 aa14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 GLULP15104 373 aa14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.73□□□□□ -0.05
SLX4-202ENST00000466154 NXPE2Q96DL1 559 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms