RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 CAPN7Q9Y6W3 813 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MCIDASD6RGH6 385 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TGFAP01135 160 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 CCL2P13500 99 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 FUT4P22083 530 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 DAP3P51398 398 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 CHN2P52757 468 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SELENOWP63302 87 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 LAPTM4AQ15012 233 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ELFN2Q5R3F8 820 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 FAM120AOSQ5T036 256 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 IL17RELQ6ZVW7 336 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SLC16A14Q7RTX9 510 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 DPPA2Q7Z7J5 298 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 RCN3Q96D15 328 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TPD52L3Q96J77 140 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 CCDC134Q9H6E4 229 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 RNF121Q9H920 327 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 CMTM6Q9NX76 183 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 STAB1Q9NY15 2570 aa23.38■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ELOVL7A1L3X0 281 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 PIP5K1CO60331 668 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 LSP1P33241 339 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ZNF84P51523 738 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TRIP10Q15642 601 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SLC36A2Q495M3 483 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 C10orf128Q5T292 105 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TMEM53Q6P2H8 277 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 PHC2Q8IXK0 858 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 DUSP13Q9UII6 198 aa23.37■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SLC22A2O15244 555 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 HPXP02790 462 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 HDDC2Q7Z4H3 204 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 LRRC18Q8N456 261 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 HPS1Q92902 700 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 PRRC1Q96M27 445 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SNX18Q96RF0 628 aa23.36■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 NPIPB13A6NJU9 1138 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 NPIPB4C9JG80 1138 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SLC2A10O95528 541 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 FAM157BP0CG42 384 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ST3GAL3Q11203 375 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TMEM158Q8WZ71 300 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 HIF3AQ9Y2N7 669 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa23.35■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SLC22A23A1A5C7 686 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SNAP29O95721 258 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 NAT2P11245 290 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SRD5A1P18405 259 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 COL8A2P25067 703 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 APEX1P27695 318 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 CDAP32320 146 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 VTCN1Q7Z7D3 282 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 BPIFA2Q96DR5 249 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TXNIPQ9H3M7 391 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 C1orf198Q9H425 327 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SIAEQ9HAT2 523 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 CDH20Q9HBT6 801 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SNX13Q9Y5W8 968 aa23.34■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 CLPTM1O96005 669 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 IFI30P13284 250 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 THBS2P35442 1172 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 YAP1P46937 504 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ERVS71-1P61550 626 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 FMODQ06828 376 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 TBC1D28Q2M2D7 210 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ALG10Q5BKT4 473 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 NABP1Q96AH0 204 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 C1orf159Q96HA4 380 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 OR51B6Q9H340 312 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SMURF2Q9HAU4 748 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 AP3M1Q9Y2T2 418 aa23.33■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 A0A1W2PPW3 197 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 J3KTA2 159 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 MGRN1O60291 552 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 NCR1O76036 304 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 PTHP01270 115 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 ZNF250P15622 560 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 MAKP20794 623 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 ALKBH6Q3KRA9 238 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 ARPINQ7Z6K5 226 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 LRRC75AQ8NAA5 344 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 LZICQ8WZA0 190 aa23.32■■□□□ 1.32
LMO1-202ENST00000428101 RDH5Q92781 318 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms