RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFA3P59666 94 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP3R1P63098 170 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MYBPHQ13203 477 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MEP1BQ16820 701 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ODF4Q2M2E3 257 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC58Q4VC31 144 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DHRS13Q6UX07 377 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC20BQ86Y33 519 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CT55Q8WUE5 264 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NSMAFQ92636 917 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TAAR9Q96RI9 348 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 AMELYQ99218 206 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC32Q9BV29 185 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EDEM2Q9BV94 578 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SRRQ9GZT4 340 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CHST11Q9NPF2 352 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HPF1Q9NWY4 346 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ETAA1Q9NY74 926 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RASD1Q9Y272 281 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GVC2 190 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NIN4 97 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ACOD1A6NK06 481 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL6IP5O75915 188 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 APOA1P02647 267 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PSKH1P11801 424 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IL7P13232 177 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SPNP16150 400 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NAT1P18440 290 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX2P48431 317 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM8P78325 824 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HSF1Q00613 529 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FMODQ06828 376 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SPEM2Q0P670 501 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IL18Q14116 193 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 P2RY14Q15391 338 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CARTPTQ16568 116 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RNFT1Q5M7Z0 435 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HBMQ6B0K9 141 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM225Q6GV28 225 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 XKRXQ6PP77 449 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MDGA2Q7Z553 956 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PXKQ7Z7A4 578 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GPAT4Q86UL3 456 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAIQ8N9R8 606 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OTOSQ8NHW6 89 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NOX4Q9NPH5 578 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF281Q9Y2X9 895 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PQ09 198 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD33BA6NCL7 494 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf172C9J069 976 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SSX4O60224 188 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GPRIN2O60269 458 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 UPK3AO75631 287 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MT-CO3P00414 261 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 F10P00742 488 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHEP01854 428 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ELK1P19419 428 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DPP4P27487 766 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CRABP1P29762 137 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EVX1P49640 407 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 BIDP55957 195 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms