RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 EVI2BP34910 448 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ACTBL2Q562R1 376 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 STEAP1BQ6NZ63 245 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF585AQ6P3V2 769 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF546Q86UE3 836 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 NKAIN3Q8N8D7 197 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ARL11Q969Q4 196 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SLC19A3Q9BZV2 496 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PPA2Q9H2U2 334 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PTTG3PQ9NZH4 202 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SLC2A1P11166 492 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 LILRB2Q8N423 598 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FABP5Q01469 135 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 OXA1LQ15070 435 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PRTGQ2VWP7 1150 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF813Q6ZN06 617 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF286AQ9HBT8 521 aa18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 LILRA5A6NI73 299 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 LMO7DNF2Z398 122 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FABP7O15540 132 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TSPAN15O95858 294 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 KIRREL2Q6UWL6 708 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TSSK2Q96PF2 358 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 IFNA1P01562 189 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 HOXD12P35452 270 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SOX18P35713 384 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GPR157Q5UAW9 335 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 WNK3Q9BYP7 1800 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SULT1B1O43704 296 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PGAP1Q75T13 922 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GJC3Q8NFK1 279 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SRP9P49458 86 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CCR9P51686 369 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SFTPA1Q8IWL2 248 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CADM3Q8N126 398 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 DCBLD2Q96PD2 775 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ARHGDIGQ99819 225 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 OBP2BQ9NPH6 170 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TPT1P13693 172 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 DNAAF1Q8NEP3 725 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FCRL1Q96LA6 429 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 BEX5Q5H9J7 111 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SYS1Q8N2H4 156 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 COX14Q96I36 57 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 MICU1Q9BPX6 476 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CTSVO60911 334 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TSC22D1Q15714 1073 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 NAGAP17050 411 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TUBG1P23258 451 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 MAP2K6P52564 334 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 BDH1Q02338 343 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 OR4N2Q8NGD1 307 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PSMF1Q92530 271 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SLC35B4Q969S0 331 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 KCND3Q9UK17 655 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 RAB22AQ9UL26 194 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ABOP16442 354 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TCEAL3Q969E4 200 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 M0QYG6 137 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GPR171O14626 319 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 RRADP55042 308 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TPBGQ13641 420 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SULT4A1Q9BR01 284 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TMEM221A6NGB7 291 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TK1P04183 234 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ACHEP22303 614 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PNLIPRP2P54317 469 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 OR13C5Q8NGS8 318 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FRG2CA6NGY1 282 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 F8W036 122 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 MYF5P13349 255 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 COL9A1P20849 921 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 IL32P24001 234 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GRB2P62993 217 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 BLOC1S1P78537 153 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SBF2Q86WG5 1849 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TWSG1Q9GZX9 223 aa18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms