RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 STK35Q8TDR2 534 aa9.83□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 UFD1Q92890 307 aa9.83□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.83□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.82□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.82□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.82□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.82□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF519Q8TB69 540 aa9.82□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 SPARCP09486 303 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 GNG2P59768 71 aa9.81□□□□□ -0.84
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GGPS1-201ENST00000282841 RDH10Q8IZV5 341 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SGCZQ96LD1 299 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 SSR3Q9UNL2 185 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 IRGMA1A4Y4 181 aa9.81□□□□□ -0.84
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
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