RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BckdkO55028 412 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgfbr3O88393 850 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfl1P18760 166 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox5bP19536 128 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PitpnaP53810 271 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CbfbQ08024 187 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss48Q14B25 312 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf354aQ61751 572 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camk2dQ6PHZ2 499 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1065Q7TR70 313 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem255aQ8BHW5 351 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lkaaear1Q8BIG2 198 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmcc3Q8R310 477 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufb2Q9CPU2 105 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a19Q9D687 634 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpastQ9QYY8 614 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dock11A2AF47 2073 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbv2A0A0B4J1G8 114 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr655E9Q252 308 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21103E9Q2Q1 267 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8220F6YKI2 213 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcn1O70165 334 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf1bP25119 474 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thbs1P35441 1170 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ucp3P56501 308 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epha4Q03137 986 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc28Q3TX51 367 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtmr11Q3V1L6 700 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb28Q3V2L0 89 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P4ha2Q60716 537 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CalcrQ60755 533 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sim2Q61079 657 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntf4Q80VU4 209 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmtm4Q8CJ61 208 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8R3Y5 413 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr99Q8VFE4 305 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd22Q9D3J5 191 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med11Q9D8C6 117 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcb10Q9JI39 715 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MyotQ9JIF9 496 aa11.54□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp36B1AQJ2 1098 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp735B1ARH2 734 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp994J3QM38 661 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult2a2P50236 285 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crmp1P97427 572 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfaip3Q60769 775 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sntb2Q61235 520 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd34Q64314 382 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timd4Q6U7R4 343 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BPC6 396 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4921517D22RikQ8CET0 269 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1sbQ8CFG8 688 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GmdsQ8K0C9 372 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DctdQ8K2D6 178 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrg1Q91XL1 342 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnot9Q9JKY0 299 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf23Q9JLR5 209 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss47A0A0N4SVQ0 395 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mesp2O08574 370 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Papss2O88428 621 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msx1P13297 303 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2rx1P51576 399 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap2s1P62743 142 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hes5P70120 167 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf11P70378 225 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epha1Q60750 977 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HlxQ61670 476 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nptx1Q62443 432 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lcn3Q62471 182 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BpiQ67E05 483 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r135Q7TQA9 312 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhfpl6Q8BM86 200 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd20Q8CDD8 419 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H1fntQ8CJI4 398 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SrrdQ8K2M3 249 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dtx2Q8R3P2 619 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccm2lQ8VCC6 481 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem5Q8VDX6 444 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgpra5Q91ZC7 304 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab3bQ9CZT8 219 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D930007J09RikQ9D2K6 131 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a18Q9DB41 320 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skp1Q9WTX5 163 aa11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ilf3Q9Z1X4 898 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45736A0A1B0GS18 427 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1360K9J6X0 313 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccr4P51680 360 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc39a12Q5FWH7 689 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr146Q60884 306 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dll1Q61483 722 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DdiasQ6NZG4 898 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1359Q7TQU5 313 aa11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38 ms