RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 LRRN3E7EW58 273 aa15.85■□□□□ 0.13
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CLN3-241ENST00000635861 M0R3H8 397 aa15.85■□□□□ 0.13
CLN3-241ENST00000635861 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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CLN3-241ENST00000635861 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
CLN3-241ENST00000635861 ACHEP22303 614 aa15.85■□□□□ 0.13
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CLN3-241ENST00000635861 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 MRGBPQ9NV56 204 aa15.83■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 DHHO43323 396 aa15.82■□□□□ 0.12
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CLN3-241ENST00000635861 SLC36A2Q495M3 483 aa15.82■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.82■□□□□ 0.12
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CLN3-241ENST00000635861 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.82■□□□□ 0.12
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CLN3-241ENST00000635861 RETREG3Q86VR2 466 aa15.81■□□□□ 0.12
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CLN3-241ENST00000635861 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.81■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 C10orf82Q8WW14 230 aa15.81■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 A0A1W2PPW3 197 aa15.8■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 UMPSP11172 480 aa15.8■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 ALDH3B1P43353 468 aa15.8■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 ZNF84P51523 738 aa15.8■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 SELPLGQ14242 412 aa15.8■□□□□ 0.12
CLN3-241ENST00000635861 HIST3H3Q16695 136 aa15.8■□□□□ 0.12
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