RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SLC25A16P16260 332 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 PSME3P61289 254 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 MYBPC1Q00872 1141 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 RUNX1T1Q06455 604 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 TRAM2Q15035 370 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CBLL1Q75N03 491 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 OFCC1Q8IZS5 231 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ANKS4BQ8N8V4 417 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 LIPHQ8WWY8 451 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 PLK3Q9H4B4 646 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SAGP10523 405 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ACADSP16219 412 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 NCK1P16333 377 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 LSP1P33241 339 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 PPOXP50336 477 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 PDLIM4P50479 330 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF84P51523 738 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 GALK2Q01415 458 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 RAB39AQ14964 217 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 LAPTM4AQ15012 233 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CARTPTQ16568 116 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ALG10Q5BKT4 473 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SVOPLQ8N434 492 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 C10orf105Q8TEF2 133 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 MCHR2Q969V1 340 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 BPIFA2Q96DR5 249 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SH3GL3Q99963 347 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 RNF121Q9H920 327 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CENPBD1B2RD01 187 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SNX3O60493 162 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 DRD4P21917 467 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 FUT4P22083 530 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 NR4A1P22736 598 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 PRDX6P30041 224 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 NRMQ8IXM6 262 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF75AQ96N20 296 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 RAB1BQ9H0U4 201 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CMAHPQ9Y471 501 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CD5LO43866 347 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 GPRIN2O60269 458 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 TSPAN19P0C672 248 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF35P13682 527 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CD47Q08722 323 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 HIST3H3Q16695 136 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 CYP4Z1Q86W10 505 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 PIMREGQ9BSJ6 248 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 ADA2Q9NZK5 511 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 EGFL7Q9UHF1 273 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD1-208ENST00000555806 TRAV27A0A087WT01 109 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 A0A096LNT2 108 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 GMNCA6NCL1 334 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 FFAR1O14842 300 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 GMNNO75496 209 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 SLC2A10O95528 541 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 SERPINA5P05154 406 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 NR2C1P13056 603 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 MAKP20794 623 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 GYS2P54840 703 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 GNGT1P63211 74 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 SLC36A2Q495M3 483 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD1-208ENST00000555806 CDK20Q8IZL9 346 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms