RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CDC73Q6P1J9 531 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ZNF573Q86YE8 665 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 RAB43Q86YS6 212 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 TMEM163Q8TC26 289 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ZNF721Q8TF20 911 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 RAB24Q969Q5 203 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 STACQ99469 402 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ARHGDIGQ99819 225 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SRRQ9GZT4 340 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR10A5Q9H207 317 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.96□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR14I1A6ND48 311 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 A8MUA0 341 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 F8A1P23610 371 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SSTR4P31391 388 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 MAP3K8P41279 467 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 EMDP50402 254 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 WNT4P56705 351 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 FOXL2P58012 376 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR2B6P58173 313 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 COPZ1P61923 177 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 MXD1Q05195 221 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 RAB40BQ12829 278 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 GPR50Q13585 617 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 TPBGQ13641 420 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR8D4Q8NGM9 314 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 TM9SF4Q92544 642 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CORO2AQ92828 525 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR7D2Q96RA2 312 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SLC22A4Q9H015 551 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PIGUQ9H490 435 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 DKK4Q9UBT3 224 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CMAHPQ9Y471 501 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 IRGMA1A4Y4 181 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 HRKO00198 91 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SCGB2A1O75556 95 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CCNKO75909 580 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ZFPL1O95159 310 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CH25HO95992 272 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 YES1P07947 543 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 COX6A1P12074 109 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 IL7P13232 177 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 MYL12AP19105 171 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 NR4A2P43354 598 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PPICP45877 212 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 RFX2P48378 723 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 TSPAN31Q12999 210 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 PCOLCEQ15113 449 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 MOGAT2Q3SYC2 334 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 C22orf42Q6IC83 251 aa5.95□□□□□ -1.46
CASC18-202ENST00000548557 ZNF544Q6NX49 715 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms